Aucune entreprise active n'est actuellement recensée de Champrougier dans la base SIRENE de l'INSEE (établissements marchands en activité). Avec 95 habitants, Champrougier fait partie des plus petites communes du département Jura et ne dispose pas de tissu économique marchand structuré.
L'activité économique locale, lorsqu'elle existe, peut relever de l'agriculture, de structures non marchandes (administration, associations) ou d'établissements rattachés à une commune voisine. Les habitants travaillent généralement dans les pôles d'emploi alentour : voir la page revenus & emploi de Champrougier pour le détail des navettes domicile-travail et des catégories socioprofessionnelles.
Agriculture
L'agriculture de Champrougier compte 2 exploitations (recensement 2020). L'orientation dominante est « bovins viande ». La surface agricole utile (SAU) couvre 17 hectares.