L'offre scolaire de Combeaufontaine repose sur une école, cœur de la vie éducative du village. Les classes y accueillent les jeunes habitants du préélémentaire à la fin du CM2. Public et privé coexistent: 1 établissement relèvent du secteur public, 1 du privé.
Le primaire de Combeaufontaine totalise 106 élèves pour 5 classes (année scolaire 2024). En moyenne, chaque classe compte 21,2 élèves. La répartition par niveau fait apparaître 39 élèves en préélémentaire (maternelle) et 67 en élémentaire. Sans école privée sur la commune, toutes les classes relèvent du secteur public.
Sur le plan du contexte social des élèves, l'IPS moyen s'établit à 96,9, profil contexte social modeste. Il sert notamment à mesurer les dispositifs d'éducation prioritaire et à contextualiser les résultats aux examens. La DEPP publie l'IPS de chaque établissement: la moyenne nationale se situe à 103 environ, soit un écart de 6,1 points en retrait ici. Les résultats du DNB 2021 affichent 94,1 % de réussite dans les collèges de Combeaufontaine, dont 62,5 % d'élèves ayant décroché une mention.
Le pilotage académique revient à l'académie de Besançon, qui met en œuvre localement les politiques nationales de l'Éducation nationale (programmes, affectations, évaluation). La voie de l'apprentissage est représentée à Combeaufontaine par un centre de formation d'apprentis. Côté filières, un lycée agricole complète l'offre d'enseignement professionnel à Combeaufontaine. Les petites communes rurales comme Combeaufontaine s'organisent fréquemment en regroupement pédagogique intercommunal (RPI) pour mutualiser les classes entre plusieurs villages. Combeaufontaine est au cœur des plateaux et forêts comtois, à 281 m d'altitude, dans un paysage de collines, ce qui pèse sur l'offre scolaire et universitaire accessible localement.
La maternelle et l'élémentaire se font à Combeaufontaine, dans une école à taille humaine. Le second degré est mutualisé avec les communes voisines via la carte scolaire. Ce maillage, hérité de la politique de ruralité, vise à préserver des écoles ouvertes dans les villages tout en garantissant l'accès à tous les cycles d'enseignement.
Côté vie scolaire, la restauration et les activités périscolaires sont souvent mutualisées à l'échelle communale ou intercommunale, via la commune et/ou la communauté de communes de rattachement. Les données publiées ici s'appuient sur l'annuaire de l'Éducation nationale et les bases DEPP pour les indicateurs de résultats.
La physionomie du bassin scolaire tient aussi à l'ancrage régional: Combeaufontaine est au cœur des plateaux et forêts comtois. Sur le plan géographique, Combeaufontaine est à 281 m d'altitude, dans un paysage de collines — l'accès aux collèges et lycées du bassin dépend largement de cet ancrage.
Les effectifs (rentrée 2024), l'IPS et les résultats aux examens (session 2021) sont publiés annuellement par la DEPP (Direction de l'évaluation, de la prospective et de la performance) du ministère de l'Éducation nationale.
