Aucune entreprise active n'est actuellement recensée de Germigney dans la base SIRENE de l'INSEE (établissements marchands en activité). Avec 79 habitants, Germigney fait partie des plus petites communes du département Jura et ne dispose pas de tissu économique marchand structuré.
L'activité économique locale, lorsqu'elle existe, peut relever de l'agriculture, de structures non marchandes (administration, associations) ou d'établissements rattachés à une commune voisine. Les habitants travaillent généralement dans les pôles d'emploi alentour : voir la page revenus & emploi de Germigney pour le détail des navettes domicile-travail et des catégories socioprofessionnelles.
Agriculture
Germigney compte 1 exploitation en agriculture biologique, pour une SAU bio de 273 hectares, dont 99 % en certification complète.