Petite commune de 226 habitants, Villers-les-Bois vit au rythme d'une économie rurale traditionnelle. Le revenu médian s'inscrit dans la moyenne française.
Seuls 17,5 % des actifs travaillent dans la commune, les autres rejoignant principalement Arbois et Dole. Les agriculteurs exploitants forment la catégorie socioprofessionnelle dominante (60,4 % des emplois).
La commune est éligible à l' Aide à Finalité Régionale. Un projet a été subventionné par l'État pour 8 916 € d'aides d'investissement.
Le revenu médian de Villers-les-Bois s'établit à 22 950 € par unité de consommation, proche de la médiane nationale. À l'échelle départementale, la médiane (22 840 €) est proche de celle de Villers-les-Bois.
À 5,3 % de chômage et 75,2 % d'emploi, Villers-les-Bois dispose d'un marché du travail mieux orienté que la médiane française, pour 112 actifs. Côté CSP, les agriculteurs exploitants (60,4 %) arrivent en tête, suivis des Ouvriers (20,4 %).
Le tissu productif de Villers-les-Bois reste marqué par l'agriculture, avec 13 établissements actifs en 2023. Parmi les secteurs représentés, celui de industrie rassemble 30,8 % des établissements.
Les comptes de Villers-les-Bois affichent en 2024 une épargne brute réduite (33 €/hab) rapportée à 544 €/hab de recettes. La durée théorique de désendettement — 1,4 années — reste courte, aux côtés de 267 €/hab d'investissement. Un projet local a bénéficié de 8 916 € de subvention de l'État (DETR/DSIL).
La fiscalité locale sur le foncier bâti s'inscrit sous la moyenne nationale, avec 36,85 % de taux global en 2024. Comparée au département (47,78 % de médiane TFB), Villers-les-Bois présente un écart de -10,93 points — la part communale pure s'élève à 34,91 %. La cotisation foncière des entreprises (CFE) ressort à 22,25 %, la taxe d'habitation (résidences secondaires et vacants) atteint 15,51 %.
Le profil économique s'interprète à l'aune du cadre régional: Villers-les-Bois est un bourg jurassien. La commune est couverte par le dispositif d'Aide à Finalité Régionale (AFR), dispositif pris en compte dans certaines politiques publiques. Les flux domicile-travail font état de 97 résidents qui vont travailler dans une autre commune. La CAF identifie 30 allocataires sur le territoire communal.