Sous-préfecture ou centralité d'agglomération, Auxerre (35 097 habitants) joue un rôle pivot dans l'organisation économique locale. Le revenu médian y est un peu en retrait par rapport à la moyenne nationale, avec un taux de pauvreté élevé (22,0 %).
Une majorité d'actifs (71,6 %) travaille sur place, les autres rejoignant principalement Monéteau et Migennes. Parmi les principaux employeurs figurent CENTRE HOSPITALIER D AUXERRE et DEPARTEMENT DE L'YONNE. Le marché du travail reste tendu (15,1 % de chômage).
La commune est éligible à la politique de la ville (QPV), ainsi qu'à un autre dispositif d'aide territoriale. Elle bénéficie du programme national Action Cœur de Ville. 4 projets ont été subventionnés par l'État pour 1 271 040 € d'aides d'investissement. 1 tiers-lieu complète l'offre d'accueil économique locale.
Avec un revenu médian par UC à 20 340 €, Auxerre se tient en retrait de la médiane nationale. Face à la médiane dans l'Yonne fixée à 21 810 €, le revenu médian communal est en retrait d'environ 1 470 €. La dispersion des revenus est importante (rapport interdécile: 3,4), les 10 % les plus modestes touchant moins de 10 860 € et les 10 % les plus aisés plus de 36 400 €.
Le taux de chômage élevé (15,1 %) et le taux d'emploi limité (61,2 %) traduisent une situation de marché du travail très difficile, pour 15 295 actifs. La CSP la plus représentée est celle des employés (31,8 %), devant les autres catégories.
Le tissu économique local compte 3 228 établissements actifs en 2023, à dominante tertiaire. Dans la ventilation par secteur, commerce, transports, hébergement et restauration pèse 30,8 % du stock d'établissements. En 2024, 471 établissements ont été créés, dans une trajectoire décennale à +15,7 % — une dynamique de création positive. Côté employeurs, CENTRE HOSPITALIER D AUXERRE et DEPARTEMENT DE L'YONNE figurent parmi les établissements les plus importants du bassin.
En 2024, la commune présente une épargne brute de 358 €/hab pour 1 574 €/hab de recettes, signe d'une gestion financière saine. Il faudrait 4,5 années d'épargne brute pour rembourser la dette (courte), dans une commune qui consacre 513 €/hab à l'investissement. 4 projets locaux ont bénéficié de 1 271 040 € de subvention de l'État (DETR/DSIL).
Le taux global de TFB en 2024 atteint 54,49 %, dépassant le repère national moyen. Comparée au département (46,26 % de médiane TFB), Auxerre présente un écart de +8,23 points — la part communale pure s'élève à 49,96 %. La cotisation foncière des entreprises (CFE) ressort à 27,80 %, la taxe d'habitation (résidences secondaires et vacants) atteint 32,43 %.
Le contexte régional pèse sur le profil économique — Auxerre est une commune bourguignonne. L'ANCT classe Auxerre à la fois dans le Quartier Prioritaire de la Ville (QPV) et dans le dispositif d'Aide à Finalité Régionale (AFR). Les flux domicile-travail font état de 3 734 résidents qui vont travailler dans une autre commune. Côté social, 9 515 allocataires sont identifiés par la CAF, dont 1 500 foyers perçoivent le RSA.