Les enfants de Châtillon sont scolarisés hors commune, dans les établissements du secteur, à commencer par Hauteroche.
Pour la scolarité primaire, les enfants de Châtillon sont accueillis à Hauteroche et dans les communes voisines, dans le cadre d'un bassin de vie partagé qui mutualise les effectifs scolaires des villages alentour. L'académie de Besançon organise la sectorisation primaire et affecte les écoliers aux établissements du bassin. Un Regroupement Pédagogique Intercommunal peut mutualiser les effectifs entre plusieurs villages ruraux voisins, maintenant ainsi une offre de proximité.
Côté vie pratique, le transport scolaire départemental prend en charge l'acheminement des élèves depuis leur village de résidence vers l'école d'affectation — un service structurant dans les territoires ruraux peu denses, où les distances domicile-école sont plus longues qu'en zone urbaine. Châtillon est caractéristique des villages du plateau jurassien, en moyenne montagne, à 516 m d'altitude; ce profil territorial façonne les choix de carte scolaire et explique en partie le recours fréquent aux RPI pour maintenir l'école à proximité des familles. Les repères utiles aux familles: la mairie centralise les démarches d'état civil et d'inscription, le département pilote le transport et les collèges, la région gère les lycées, l'académie arbitre la sectorisation. Ce schéma à plusieurs niveaux est typique des communes rurales françaises.
Sans établissement évalué de Châtillon, les indicateurs nationaux (IPS, résultats au brevet et au bac) sont disponibles sur les établissements du secteur, en particulier à Hauteroche.
Sur le plan administratif, Châtillon est rattachée à l'académie de Besançon, circonscription qui pilote les établissements scolaires sur un territoire regroupant plusieurs départements. Le fonctionnement en RPI (regroupement pédagogique intercommunal) est une modalité courante pour les communes de ce calibre, permettant de partager les effectifs entre villages voisins. Châtillon est caractéristique des villages du plateau jurassien, en moyenne montagne, à 516 m d'altitude, un contexte qui conditionne l'organisation du bassin scolaire.
Sans école sur le territoire, la scolarisation passe par la sectorisation académique: chaque adresse est rattachée à une école du secteur, puis à un collège (sectorisation départementale) et à un lycée (sectorisation académique). Le rectorat de l'académie de Besançon publie les périmètres.
Sources des données: annuaire de l'Éducation nationale, DEPP (indicateurs de résultats des lycées et IPS), effectifs scolaires. En l'absence d'école à Châtillon, les éléments à destination des familles portent sur le bassin de scolarisation.
Le pilotage des parcours éducatifs s'effectue dans un cadre régional où Châtillon est caractéristique des villages du plateau jurassien. Sur le plan géographique, Châtillon est en moyenne montagne, à 516 m d'altitude — l'accès aux collèges et lycées du bassin dépend largement de cet ancrage.
Les effectifs scolaires reflètent la structure démographique de Châtillon (jeunes, familles, vieillissement).