Aucune entreprise active n'est actuellement recensée de Côtebrune dans la base SIRENE de l'INSEE (établissements marchands en activité). Avec 76 habitants, Côtebrune fait partie des plus petites communes du département Doubs et ne dispose pas de tissu économique marchand structuré.
L'activité économique locale, lorsqu'elle existe, peut relever de l'agriculture, de structures non marchandes (administration, associations) ou d'établissements rattachés à une commune voisine. Les habitants travaillent généralement dans les pôles d'emploi alentour : voir la page revenus & emploi de Côtebrune pour le détail des navettes domicile-travail et des catégories socioprofessionnelles.
Agriculture
L'agriculture de Côtebrune compte 3 exploitations (recensement 2020). L'orientation dominante est « bovins lait ». La surface agricole utile (SAU) couvre 258 hectares.