Aucune entreprise active n'est actuellement recensée de Fay-en-Montagne dans la base SIRENE de l'INSEE (établissements marchands en activité). Avec 90 habitants, Fay-en-Montagne fait partie des plus petites communes du département Jura et ne dispose pas de tissu économique marchand structuré.
L'activité économique locale, lorsqu'elle existe, peut relever de l'agriculture, de structures non marchandes (administration, associations) ou d'établissements rattachés à une commune voisine. Les habitants travaillent généralement dans les pôles d'emploi alentour : voir la page revenus & emploi de Fay-en-Montagne pour le détail des navettes domicile-travail et des catégories socioprofessionnelles.
Agriculture
Le bio de Fay-en-Montagne repose sur 1 exploitation, pour une SAU bio de 73 hectares.