Aucune entreprise active n'est actuellement recensée de Pernes-les-Fontaines dans la base SIRENE de l'INSEE (établissements marchands en activité). Pernes-les-Fontaines ne dispose pas, à ce jour, d'établissement marchand répertorié sur son territoire.
L'activité économique locale, lorsqu'elle existe, peut relever de l'agriculture, de structures non marchandes (administration, associations) ou d'établissements rattachés à une commune voisine. Les habitants travaillent généralement dans les pôles d'emploi alentour : voir la page revenus & emploi de Pernes-les-Fontaines pour le détail des navettes domicile-travail et des catégories socioprofessionnelles.
Agriculture
On recense 33 exploitations bio à Pernes-les-Fontaines, pour une SAU bio de 571 hectares, dont 75 % en certification complète.