La commune ne compte aucun établissement scolaire. Les élèves sont accueillis dans les écoles des communes limitrophes, notamment Gendrey.
Les jeunes habitants de Rouffange sont rattachés au bassin scolaire voisin et fréquentent notamment les écoles de Gendrey — un schéma classique pour les petits villages ruraux ou de montagne. La carte scolaire est définie par l'académie de Besançon, qui arrête annuellement les périmètres de sectorisation et affecte les enseignants dans les établissements du secteur. Le département complète le dispositif en assurant le transport des collégiens et la gestion des infrastructures.
Pour les familles, le paramètre concret à considérer reste le transport scolaire: le département organise le ramassage des écoliers et collégiens entre les villages rattachés et les établissements du bassin, ce qui conditionne la vie quotidienne des élèves en âge scolaire. Sur le plan physique, Rouffange est une commune de l'arc jurassien, entre plateaux et vallées, à 268 m d'altitude, dans un paysage de collines — autant d'éléments qui modulent la géographie scolaire effective, du choix des regroupements à la logistique de transport des élèves. Concrètement, les enfants de Rouffange suivent une scolarité organisée à l'échelle du bassin: inscription via la mairie ou l'école de rattachement, transport scolaire départemental, périscolaire communal ou intercommunal, et passage au collège de secteur à l'issue du CM2.
Les données de performance scolaire portent sur les établissements du bassin de rattachement, à commencer par ceux de Gendrey.
L'académie de Besançon supervise les établissements de Rouffange. Elle publie chaque année les résultats consolidés (taux de réussite au brevet et au baccalauréat, IPS des établissements) et coordonne les politiques éducatives territoriales. Comme nombre de petites communes rurales, la scolarisation peut s'appuyer sur un regroupement pédagogique intercommunal (RPI) avec les villages voisins — dispositif qui permet de maintenir une offre scolaire de proximité malgré des effectifs trop faibles pour une école autonome. La carte scolaire locale prend place dans un environnement où Rouffange est une commune de l'arc jurassien, entre plateaux et vallées, à 268 m d'altitude, dans un paysage de collines.
Sans école sur le territoire, la scolarisation passe par la sectorisation académique: chaque adresse est rattachée à une école du secteur, puis à un collège (sectorisation départementale) et à un lycée (sectorisation académique). Le rectorat de l'académie de Besançon publie les périmètres.
Sources des données: annuaire de l'Éducation nationale, DEPP (indicateurs de résultats des lycées et IPS), effectifs scolaires. En l'absence d'école à Rouffange, les éléments à destination des familles portent sur le bassin de scolarisation.
La physionomie du bassin scolaire tient aussi à l'ancrage régional: Rouffange est une commune de l'arc jurassien, entre plateaux et vallées. L'accessibilité des établissements du secondaire est conditionnée par le cadre physique — la commune est à 268 m d'altitude, dans un paysage de collines.