Le territoire communal accueille 4 espaces reconnus pour leur intérêt écologique — 2 sites Natura 2000, 1 ZNIEFF de type 1 et 1 ZNIEFF de type 2, soit une densité notable de périmètres sur les 5,0 km² communaux. La surface communale intersectant Natura 2000 atteint 471,4 hectares.
Les contributeurs du portail GBIF ont consigné 1 025 observations à Joncherey, où les oiseaux arrive en tête. L'espèce la plus signalée est Chevesne commun, Chevaine commun (94 observations), devant Blageon.
Le contrôle sanitaire ARS fait apparaître, avec une conformité globale excellente (100,0 %) sur 19 analyses du contrôle sanitaire pour l'eau distribuée de Joncherey. L'Agence de l'eau surveille la qualité des rivières de Joncherey via 1 station (cours d'eau principal suivi: La Coeuvatte).
La qualité de l'air à Joncherey ressort en moyenne sur la classe ATMO « moyen », mesuré par l'AASQA ATMO Bourgogne-Franche-Comté — polluant dominant: ozone (O₃). Sur l'année, 12 journées sont référencées, dont 1 jour bon, 2 jours dégradés et 1 jour mauvais.
Le ciel nocturne de Joncherey bénéficie d'une pollution lumineuse faible (classement « extinction totale probable » (radiance VIIRS moyenne: 3,7 nW/cm²/sr), évolution -82,2 % sur la décennie (tendance en baisse)) — un atout pour l'observation astronomique amateur comme pour la faune nocturne. La commune pratique l'extinction nocturne de l'éclairage public, geste favorable à la biodiversité et aux économies d'énergie.
Le cadre régional environnemental: Joncherey est dans la tradition des communes de Franche-Comté. Physiquement, Joncherey est à 380 m d'altitude, sur un relief de plateau ou de coteaux, baignée par La Coeuvatte — autant de facteurs pesant sur la qualité des milieux. Le mix local de production d'énergie renouvelable est dominé par la filière solaire (29 installations).
- Arrêtés CatNat 6
- Espaces naturels protégés 4
- Observations naturalistes 1 025
- Qualité de l'air 2,3 /4
- Dernier prélèvement eau 16/12/2025
Qualité de l'air de Joncherey
Indice ATMO : Moyen le 16/05/2026
Indice journalier publié par ATMO Bourgogne-Franche-Comté selon les modalités de l'arrêté du 10 juillet 2020 (5 polluants surveillés : NO₂, O₃, PM10, PM2.5, SO₂).
Sous-indices par polluant
- NO₂ — Dioxyde d'azote 1/6 Bon
- O₃ — Ozone 2/6 Moyen
- PM10 — Particules fines 1/6 Bon
- PM2.5 — Particules très fines 1/6 Bon
- SO₂ — Dioxyde de soufre 1/6 Bon
Source : Atmo France — fédération des AASQA agréées par le ministère de la Transition écologique. atmo-france.org
La qualité de l'air influence les conditions d'accès aux soins de Joncherey (asthme, allergies, maladies respiratoires).
Biodiversité et zones naturelles
Le territoire de Joncherey recense 4 zonages de protection de la nature, répartis sur 4 typologies différentes.
Natura 2000 (Habitats) (1)
Natura 2000 (Oiseaux) (1)
ZNIEFF type 1 (1)
ZNIEFF type 2 (1)
Source :
Les naturalistes ont enregistré 1 025 observations sur ce secteur, portées principalement par les oiseaux.
1 025 observations naturalistes répertoriées
Top 50 des espèces les plus observées
Source : GBIF — données d'observations dans un rayon approximatif de la commune.
Air, déchets et éclairage
12 relevés journaliers permettent d'évaluer la qualité de l'air de Joncherey à 2,3/4 en moyenne (« Moyen »).
Sur 12 jours observés de Joncherey, la qualité de l'air a été jugée « bonne » 8% du temps, avec 25% de journées en qualité problématique.
Niveaux moyens par polluant mesuré de Joncherey: le O3 se distingue comme le polluant le plus marqué (indice 2,2 sur une échelle de 1 à 4).
Données fournies par ATMO Bourgogne-Franche-Comté (association agréée de surveillance de la qualité de l'air). Période : 2025-02 à 2026-01.
Source : Indice ATMO quotidien par commune — Atmo France — ODbL 1.0
Observée depuis l'espace, Joncherey relève de la classe « Extinction totale probable » de radiance nocturne (extinction nocturne détectée par satellite).
Courbe annuelle de la luminosité nocturne vue depuis l'espace. À Joncherey, la radiance moyenne s'établit à 3,7 nW/cm²/sr avec une évolution de -82,2% sur la décennie (nette baisse (commune plus sombre)).
Données : Cerema — satellite VIIRS Day/Night Band. La radiance mesure la lumière nocturne vue depuis l'espace. Une baisse indique une réduction de la pollution lumineuse (extinction, rénovation LED).
Source : Cerema — Cartographie nationale des pratiques d'éclairage nocturne — Cerema (Pôle satellite) — Licence Ouverte v2.0
Énergie
Joncherey consomme 4 432 MWh d'énergie, soit 3,1 MWh par habitant.