L'offre scolaire du Villey se déporte sur les communes voisines. Chaumergy accueille une part des élèves.
Côté primaire, la commune s'appuie sur le maillage du bassin de vie: les élèves sont rattachés aux écoles de Chaumergy et des communes environnantes, selon l'adresse du domicile et la sectorisation en vigueur. L'autorité pédagogique de rattachement est l'académie de Besançon. Les petites communes rurales sans école s'organisent souvent en RPI (Regroupement Pédagogique Intercommunal), dispositif qui associe plusieurs villages pour mutualiser classes et enseignants à l'échelle intercommunale.
L'organisation scolaire effective passe par le transport: bus de ramassage pour les écoliers, cars scolaires pour les collégiens vers les chefs-lieux de canton, transport mixte voire adapté en zone de montagne ou de faible densité, selon les configurations locales. Le contexte géographique — Le Villey est une commune du massif jurassien, sur un relief modérément vallonné, à 210 m d'altitude — s'imprime dans l'organisation scolaire réelle: dispersion des écoles, ramassage étendu, cycles parfois mutualisés entre plusieurs villages. Les familles qui s'installent au Villey doivent composer avec une scolarisation déportée sur les communes voisines: les démarches d'inscription passent par la mairie de rattachement, le transport est assuré par le département, et la carte scolaire dépend de l'adresse précise du domicile.
Pour les indicateurs chiffrés (IPS, réussite au brevet, réussite au bac), il faut se reporter aux établissements du secteur, dont ceux de Chaumergy.
L'académie de Besançon est la tutelle éducative de rattachement. À ce titre, elle publie les résultats aux examens, définit la sectorisation et assure la gestion des personnels enseignants exerçant dans les établissements du territoire. Comme nombre de petites communes rurales, la scolarisation peut s'appuyer sur un regroupement pédagogique intercommunal (RPI) avec les villages voisins — dispositif qui permet de maintenir une offre scolaire de proximité malgré des effectifs trop faibles pour une école autonome. Le Villey est une commune du massif jurassien, sur un relief modérément vallonné, à 210 m d'altitude, un contexte qui conditionne l'organisation du bassin scolaire.
La carte scolaire — définie conjointement par la commune de rattachement et l'académie de Besançon — détermine l'école puis le collège et le lycée fréquentés. Les familles du Villey se réfèrent à l'adresse du domicile pour identifier leur établissement d'affectation.
Sources des données: annuaire de l'Éducation nationale, DEPP (indicateurs de résultats des lycées et IPS), effectifs scolaires. En l'absence d'école au Villey, les éléments à destination des familles portent sur le bassin de scolarisation.
Le pilotage des parcours éducatifs s'effectue dans un cadre régional où Le Villey est une commune du massif jurassien. Ce contexte physique (sur un relief modérément vallonné, à 210 m d'altitude) module les temps de trajet scolaires.
Les effectifs scolaires reflètent la structure démographique du Villey (jeunes, familles, vieillissement).