La commune s'impose comme pôle scolaire local, avec 5 écoles, 3 collèges et 1 lycée. Sur le plan des statuts, on compte 9 établissements publics et 4 privés.
À la rentrée 2024, 562 élèves fréquentaient les 24 classes du premier degré de Semur-en-Auxois. Soit une taille de classe moyenne de 23,4 élèves. La répartition par niveau fait apparaître 192 élèves en préélémentaire (maternelle) et 360 en élémentaire. Le public accueille la majorité des classes, avec 4 classes publiques pour 1 dans le privé. Une classe ULIS est implantée localement, accueillant 10 élèves dans le cadre d'une scolarisation adaptée.
L'IPS moyen, 104,1, positionne les établissements de Semur-en-Auxois dans la catégorie profil social mixte. L'indice de position sociale est défini par le ministère de l'Éducation nationale pour objectiver le contexte social des écoles, collèges et lycées. 95,0 % des candidats issus des lycées de Semur-en-Auxois ont décroché leur baccalauréat à la session 2023. À l'examen du brevet, les collèges de Semur-en-Auxois affichent 92,4 % de réussite (session 2021), dont 61,9 % d'élèves ayant décroché une mention.
187 étudiants fréquentent les 3 établissements post-bac de Semur-en-Auxois.
En matière de pilotage éducatif, Semur-en-Auxois est rattachée à l'académie de Dijon. Cette circonscription administrative constitue l'échelon intermédiaire entre le ministère et les établissements de terrain. Un centre de formation d'apprentis (CFA) est implanté sur le territoire, complétant l'offre post-bac par la voie de l'apprentissage. Le territoire accueille un établissement d'enseignement agricole (LEGTA), voie professionnelle spécialisée. Semur-en-Auxois est dans les paysages de Bourgogne, à 314 m d'altitude, sur un relief de plateau ou de coteaux, un contexte qui conditionne l'organisation du bassin scolaire.
Pour les familles, Semur-en-Auxois offre un parcours scolaire continu de la maternelle au lycée, avec un choix d'établissements public et parfois privé. La carte scolaire de l'académie de Dijon détermine l'affectation en collège et lycée selon l'adresse du domicile.
L'organisation pratique de la scolarité fait intervenir plusieurs échelons: la commune pour les écoles, le département pour les collèges (construction, entretien, transport scolaire), la région pour les lycées. Les indicateurs publiés (IPS, taux de réussite au brevet et au bac) sont calculés par la DEPP, direction d'évaluation du ministère.
Semur-en-Auxois est dans les paysages de Bourgogne, un cadre régional qui pèse sur la carte scolaire locale. L'accessibilité des établissements du secondaire est conditionnée par le cadre physique — la commune est à 314 m d'altitude, sur un relief de plateau ou de coteaux.
Les données affichées s'appuient sur les bases publiques de l'Éducation nationale (annuaire EN, DEPP) (rentrée 2024) (session 2023) (session 2021). Les indicateurs évoluent d'une année scolaire sur l'autre, selon les millésimes publiés.
