Aucune entreprise active n'est actuellement recensée de Saint-Thonan dans la base SIRENE de l'INSEE (établissements marchands en activité). Saint-Thonan ne dispose pas, à ce jour, d'établissement marchand répertorié sur son territoire.
L'activité économique locale, lorsqu'elle existe, peut relever de l'agriculture, de structures non marchandes (administration, associations) ou d'établissements rattachés à une commune voisine. Les habitants travaillent généralement dans les pôles d'emploi alentour : voir la page revenus & emploi de Saint-Thonan pour le détail des navettes domicile-travail et des catégories socioprofessionnelles.
Agriculture
L'activité agricole biologique de Saint-Thonan s'articule autour de 1 exploitation, pour une SAU bio de 48 hectares, dont 100 % en certification complète.